Tomoaki Matsuura Research Group Homepage

Activities

Selected publication list

1.       Matsuura T, Tanimura N, Hosoda K, Yomo T, Shimizu Y Reaction dynamics analysis of a reconstituted Escherichia coli protein translation system by computational modeling. Proc Natl Acad Sci U S A 114(8), E1336-E44 (2017).
Google Scholar PudMed Proc Natl Acad Sci U S A

2.       Uyeda A, Nakayama S, Kato Y, Watanabe H, Matsuura T Construction of an in Vitro Gene Screening System of the E. coli EmrE Transporter Using Liposome Display. Anal Chem 88(24), 12028-35 (2016).
Google Scholar PubMed Anal Chem

3.       Ohta N, Kato Y, Watanabe H, Mori H, Matsuura T In vitro membrane protein synthesis inside Sec translocon-reconstituted cell-sized liposomes. Sci Rep 6 36466 (2016).
Google Scholar PubMed

4.       Soga H, Fujii S, Yomo T, Kato Y, Watanabe H, Matsuura T In vitro membrane protein synthesis inside cell-sized vesicles reveals the dependence of membrane protein integration on vesicle volume. ACS Synth Biol 3(6), 372-9 (2014).
Google Scholar PubMed ACS Synth Biol

5.       Kazuta Y, Matsuura T, Ichihashi N, Yomo T Synthesis of milligram quantities of proteins using a reconstituted in vitro protein synthesis system. J Biosci Bioeng 118(5), 554-7 (2014).
Google Scholar PubMed J Biosci Bioeng

6.       Fujii S, Matsuura T, Sunami T, Nishikawa T, Kazuta Y, Yomo T Liposome display for in vitro selection and evolution of membrane proteins. Nat Protoc 9(7), 1578-91 (2014).
Google Scholar PubMed Nat Protoc

7.       Fujii S, Matsuura T, Sunami T, Kazuta Y, Yomo T In vitro evolution of alpha-hemolysin using a liposome display. Proc Natl Acad Sci U S A 110(42), 16796-801 (2013).
Google Scholar PubMed Proc Natl Acad Sci U S A

8.       Matsuura T, Hosoda K, Kazuta Y, Ichihashi N, Suzuki H, Yomo T Effects of compartment size on the kinetics of intracompartmental multimeric protein synthesis. ACS Synth Biol 1(9), 431-7 (2012).
Google Scholar PubMed ACS Synth Biol

9.       Matsuura T, Kazuta Y, Aita T, Adachi J, Yomo T Quantifying epistatic interactions among the components constituting the protein translation system. Mol Syst Biol 5297 (2009).
Google Scholar PubMed Mol Syst Biol

10.      Matsuura T, Pluckthun A Selection based on the folding properties of proteins with ribosome display. FEBS Lett 539(1-3), 24-8 (2003).
Google Scholar PubMed FEBS Lett

11.      Matsuura T, Yamaguchi M, Ko-Mitamura E P, Shima Y, Urabe I, Yomo T Importance of compartment formation for a self-encoding system. Proc Natl Acad Sci U S A 99(11), 7514-7 (2002).
Google Scholar PubMed Proc Natl Acad Sci U S A

12.      Matsuura T, Miyai K, Trakulnaleamsai S, Yomo T, Shima Y, Miki S, Yamamoto K, Urabe I Evolutionary molecular engineering by random elongation mutagenesis. Nat Biotechnol 17(1), 58-61 (1999).
Google Scholar PubMed Nat Biotechnol

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Awards


・2009年度 酵素工学研究会奨励賞「無細胞翻訳系を利用したタンパク質の機能改変に関する研究」
・2014年度 第3回 大阪大学総長奨励賞(研究部門)
・2015年度 第4回 大阪大学総長奨励賞(研究部門)
・2016年度 第52回 日本生物工学会研究奨励賞(斎藤賞)「セルフリータンパク質合成系を用いた進化分子工学技術の開発」


Invited talks (International meetings) (only last 5years)

1.       Tomoaki Matsuura (Feb 4, 2017). ”Evolutionary engineering and characterization of membrane proteins using liposome display” 2nd Korea-Japan Smart Biodesign Workshop: Technology exchange for green biotechnology (Sendai City Information & Industry Plaza, Sendai, Japan)

2.       Tomoaki Matsuura (Nov 22-23, 2015). ”Dynamics of biological systems constructed in vitro” 新学術領域研究「動的機能と秩序」第4回国際シンポジウム (九州大学西新プラザ・福岡市)

3.       Tomoaki Matsuura (Aug 24-26, 2015). “The time development of the protein synthesis involves a collapse and regrowth of the reaction network” QBic Symposium 2015, High-dimensional data for the design principles of life (RIKEN Quantitative Biology Center, Osaka)

4.       Tomoaki Matsuura (June 15-20, 2015). “In vitro Selection and Evolution of Membrane Proteins” Gordon Research Conferences in Proteins (Boston, U.S.A.)

5.       Tomoaki Matsuura (July, 27-30, 2014). In vitro evolution of alfa-hemolysin using a liposome display. Young Investigators Talk session in Protein Society Meeting 2014 (SanDiego, U.S.A.).

6.       Tomoaki Matsuura (Arpril 10, 2014). Engineering membrane proteins entirely in vitro with liposome display technology. In 2014 KSBB Spring Meeting and International Symposium (Hyundai Hotel, Gyeongju, Korea).

7.       Tomoaki Matsuura (Jan 24, 2014). “Origins of life”. In Japan-France Frontier of Science Symposium (Organized by JSPS and CNS), (Metz, France).

8.       Tomoaki Matsuura (Jan 21, 2014). ”In vitro evolution and selection of membrane proteins using liposome display technology 1st Korea-Japan Smart Biodesign Workshop: Technology exchange for green biotechnology (Tohoku University, Sendai, Japan)

Invited talks (Domestic meetings, in Japanese) (only last 5years)

1.       松浦友亮(2016年11月30日-12月2日)“Evolutionary engineering and characterization of membrane proteins using liposome display” 第39回日本分子生物学会年会(パシフィコ横浜(神奈川))

2.       松浦友亮(2016年11月25-26日)「リポソーム内で膜タンパク質を合成するシステムの構築と応用」第29回植物脂質シンポジウム(大阪大学会館・豊中市)

3.       松浦友亮(2016年11月20日-12月2日)「In vitro 進化分子工学を用いたタンパク質デザイン」第56回生物物理若手の会 夏の学校

4.       松浦友亮(2016年9月28-30日))「セルフリータンパク質合成系を用いた進化分子工学技術の開発」第52回生物工学奨励賞(斎藤賞) 受賞講演(富山国際会議場など(富山)

5.       松浦友亮(2016年9月25-27日)「リポソームディスプレイ法を用いた進化分子工学技術の開発と応用」第89回日本生化学会大会(仙台国際センター・東北大学川内北キャンパス(宮城))

6.       松浦友亮 (2016年8月4-5日)「生体高分子を用いた構成的アプローチ」研究会「物理学的普遍性から生物学的普遍性へ」(東京大学駒場キャンパス 21KOMCEE east 011教室)

7.       松浦友亮 (2016年4月14-15日)「in vitro で組み上げた生命システムから学べること」細胞システムの動態と論理 VIII(理化学研究所(和光))

8.       松浦友亮(2016年1月29日)「無細胞タンパク質合成系を用いた膜タンパク質進化分子工学」第4回 ネオバイオ分子研究会(大阪府立大学I-site なんば・大阪市)

9.       松浦友亮 (2015年12月1日-4日)「全成分タンパク質合成反応モデルの構築とこれを用いた反応ダイナミクス解析」第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会(神戸ポートアイランド・神戸市)

10.     松浦友亮 (2015年10月26日-28日)「バイオ界面を利用したin vitro進化分子工学」日本生物工学会第67回大会 (城山観光ホテル・鹿児島市)

11.     松浦友亮 (2015年6月24-60日)「無細胞タンパク質合成系を用いた膜タンパク質進化分子工学」第15回日本蛋白質科学会年会 (あわぎんホール, 徳島市)

12.     松浦友亮 (2014年12月14-15日)「in vitroで生体分子を使って組み上げる生命システム」In 国際高等研研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能ネットワークとダイナミクスの解明」第1回研究会

13.     松浦友亮 (2014年1月15日)「無細胞系を用いたタンパク質エンジニアリングの新技術」In 2013年度日本生物工学会技術セミナー (神戸大学).

14.     松浦友亮 (2013年12月3-6日)「無細胞タンパク質合成系を用いた構成的アプローチ」第36回日本分子生物学会年会 (神戸国際会議場ほか).

15.     松浦友亮(2012年3月8日)「細胞サイズの微小反応場における無細胞蛋白質合成技術の確立」第7回「バイオものづくり」シンポジウム(理化学研究所(和光))

16.     松浦友亮(2012年1月8-9日)「細胞サイズの微小反応場における生化学反応の性状解析」第4回定量生物の会(名古屋大学)